安徽醫科大學公共衛生教育發端于1926年學校前身上海東南醫科大學的創辦，經過一批批老東南人的建設和傳承，公共衛生教育深入發展，科學的公共衛生教學機構初現雛形。1950年東南醫學院由蔣本沂教授負責組建公共衛生學科。1957年調整為衛生學教研室、流行病學教研室、保健組織學(含衛生統計)教研室；1959年創辦安徽醫學院衛生系；1984年負責籌建衛生管理系(現為安徽醫科大學衛生管理學院)；1985年成立安徽醫學院預防醫學研究所，實行系所合一，同年改名安徽醫科大學衛生系；2000年撤系建院更名為安徽醫科大學公共衛生學院。1977年招收復系后首屆本科生，1986年開始招收碩士研究生，2003年開始招收博士研究生。

　　學院現為公共衛生與預防醫學一級學科博士學位授權單位，擁有公共衛生與預防醫學一級學科博士后科研流動站、公共衛生與預防醫學一級學科碩士學位授權點、公共衛生專業碩士（MPH）學位授權點和自主設置目錄外衛生檢驗與檢疫學專業碩士學位授權點。學院下設流行病與衛生統計學系、職業衛生與環境衛生學系、營養與食品衛生學系、兒少衛生與婦幼保健學系、衛生毒理學系、衛生檢驗與檢疫學系、預防醫學教學中心和預防醫學實驗教學中心。

　　學院建有公共衛生與預防醫學國家級實驗教學示范中心，獲批建設出生人口健康教育部重點實驗室、預防醫學和婦幼衛生2個中央與地方共建高校特色優勢學科綜合實驗室，人口健康與優生、重大自身免疫性疾病、環境毒理學3個安徽省重點實驗室、預防醫學專業安徽省省級示范實習實訓中心、安徽省預防醫學虛擬仿真實驗教學中心、數據科學中心等教學研究機構。在2017年國家教育部第四輪學科水平評估中，學院公共衛生與預防醫學一級學科全國排名并列11位；流行病與衛生統計學和兒少衛生與婦幼保健學為安徽省省級重點學科,公共衛生與預防醫學學科獲得安徽省高校國內一流學科A類和地方高水平大學項目建設；藥理學與毒理學學科連續進入ESI全球1%并獲得安徽省高校世界一流學科獎補項目。

　　學院著力推進教學改革，創新人才培養模式，不斷提升教學質量和人才培養質量。開設有預防醫學、婦幼保健醫學、食品質量與安全、食品衛生與營養學、衛生檢驗與檢疫五個本科專業，全國建立近30家實踐教學基地。預防醫學專業獲批為教育部、財政部的國家級特色專業建設點。擁有省級特色專業1個，省級教學團隊3個，國家級精品課程/國家級精品資源共享課程1門，省級重點課程/精品開放課程9門，省級“名師（大師）工作室”2個。榮獲國家級教學成果獎二等獎1項，省級教學成果獎特等獎1項、一等獎4項、二等獎和三等獎多項。近年來，學生培養質量穩步提高，畢業生初次就業率在95%以上，學生屢次在國家和省級“互聯網+”大學生創新創業大賽、大學生社會實踐和志愿服務等各級各類項目和活動中創造佳績。

　　學院著力提升科研創新能力，整合資源發展，已形成“重大自身免疫性疾病的流行病學研究”“生命早期環境暴露的健康一生影響”“職業與環境因素的健康危害效應”“生殖與發育毒理”等為代表的具有鮮明優勢和特色的科學研究方向。主持有國家科技支撐計劃重大項目、國家重大研究計劃專項、國家高技術研究發展計劃（863計劃）、國家重點研發計劃等國家課題，獲得國家自然科學基金近110項，國家社科基金1項，國家自然科學基金重點項目3項；近五年累計發表SCI論文800余篇，出版教材和專著40余部，擔任全國規劃教材主編/副主編10多人次，參編70余人次。榮獲中華醫學科技獎一等獎1項，三等獎2項，中華預防醫學會科學技術獎4項，國家新聞出版總署“三個一百”原創圖書出版工程獎（自然科學類）1項，安徽省科學技術獎一等獎1項，其它省級各類獎項20余項，1著作獲選《中華醫學百科全書》展出。

　　學院加強國內外交流，提升學術水平，深化內涵建設。近20個學術團體和科研研究所（中心）掛靠公共衛生學院，包括安徽省營養學會、安徽省環境誘變劑學會、環境與健康研究所等省級學會和研究機構,被評為2011-2017年安徽省預防醫學會先進單位；依托創辦的《中華疾病控制雜志》第四次榮獲中華預防醫學會系列雜志優秀期刊一等獎。與美國、歐洲、俄羅斯、澳大利亞、日本、中國香港和臺灣地區高校和研究機構廣泛開展合作交流，定期選派師生訪問交流，共同促進公共衛生各學科領域的科學研究和人才培養等工作。

　　學院現有教職工111人，其中教授30人，副教授31人，校聘副教授15人,特聘海外教授/兼職教授8人，專任教師博士占比82.4%。現有安徽省青年皖江學者1人，安徽省杰青2人，安徽省教學名師5人，安徽省學術與技術帶頭人/后備人選14人。被授予全國先進工作者稱號1人，全國優秀教師1人，全國優秀輔導員1人，入選教育部首批全國萬名優秀創新創業導師人才庫1人。在校本科生1131人，全日制碩博研究生364人。

　　邁入新時代，學院將緊緊圍繞立德樹人的根本任務，弘揚“好學力行，造就良醫”的校訓精神，秉承“厚德至上，博學濟世”的校風，踐行“學達天下為公，行護健康之衛”的院訓理念，牢牢把握新時代國家衛生與健康發展機遇，廣泛深入開展公共衛生教育教學、科學研究、人才培養和社會服務。始終致力于培養高水平、復合型的公共衛生創新人才，努力建設高水平、有鮮明特色的公共衛生學院，奮力推動國內一流公共衛生學院建設和世界一流學科建設步伐。