揚州大學的醫學教育最早可追溯到創立于1950年的蘇北衛生行政干部學校，1958年升格為揚州醫學專科學校。1984年經原國家教委批準升格為本科院校，更名為揚州醫學院。1992年，與在揚其他5所高校合并組建揚州大學。2019年，秉承“醫教研協同、學科融合創新”的發展理念，學校成立醫學部。2025年，為優化醫學部運行管理機制，推進醫教研一體化發展，組建基礎醫學院·公共衛生學院、中醫藥學院、護理學院、第一臨床醫學院（掛靠直屬附屬醫院）。

學部現有全日制本碩博學生共計6500余人，留學生220余人。開設五年制臨床醫學、中西醫臨床醫學、預防醫學和四年制藥學、醫學檢驗技術、護理學等6個本科專業，以及全英文授課的留學生臨床醫學與藥學項目，其中臨床醫學、護理學為國家級一流本科專業建設點，通過教育部專業認證。擁有一級學科博士學位授權點1個，博士專業學位類別1個，一級學科碩士學位授權點7個，碩士專業學位類別6個，博士后流動站2個。

學部擁有一支學術水平較高、綜合實力較強的師資隊伍。45歲及以下專任教師中博士學位占比97.2%。具有外校學緣背景專任教師141人，占75%。擁有國家級青年人才、教育部新世紀優秀人才、江蘇特聘教授、省“雙創計劃”“333工程”“青藍工程”“六大人才高峰”“科教興衛工程”等一批國家級/省級高層次人才。擁有教育部臨床醫學類專業教學指導委員會委員、省醫藥類研究生教育指導委員會委員等國家級/省級學術機構兼職40余人。

臨床醫學、免疫學、藥理學與毒理學、生物學與生物化學、微生物學、分子生物學與遺傳學等6個學科進入ESI全球排名前1%。擁有國家中醫藥管理局重點研究室1個、省級重點實驗室2個。近年來承擔國家重點研發計劃、國家自然科學基金等省部級以上課題400余項，獲省部級及以上科研成果獎10項，取得了一大批高水平的科研成果，產生了重要的社會和經濟效益。擁有13所附屬醫院，其中三級甲等綜合醫院或專科醫院10所，以及揚州大學附屬揚州疾病預防控制中心、遍布省內外的40余所教學實習醫院、5家藥學教學基地。《實用臨床醫藥雜志》為全國公開發行的科技核心期刊，連續五屆獲教育部“中國高校優秀期刊獎”，現為中國高校科技期刊研究會醫學期刊專業委員會主任委員單位。

七秩芳華，弦歌不輟。揚州大學醫學教育歷經70余載辦學歷程，全體師生秉承“堅苦自立”的校訓精神，弘揚“厚德惠生、博極醫源”的醫學精神，以服務教育強國、健康中國建設為己任，積極構建并踐行具有鮮明特色的“醫德醫術兼優、基礎臨床融通、全程技能實踐、醫教協同育人”的人才培養模式，為高質量醫學人才自主培養、高水平醫學科技自立自強作出了重要貢獻，贏得了社會各界的廣泛贊譽。