數學科學學院是學校創建之初設立的院系之一，曾使用數學科、應用數學系、經濟管理系、數理信息系、數學與計算機科學系、數學與計算機科學學院、大數據科學學院等名稱，2024年經院系整合更名為數學科學學院。學院下設數學系、數據科學系、公共數學部、數學師范教研室、實驗中心。

學院現有教師54名，其中教授5名，副教授18名，高級實驗師2名，博士30名，碩士生導師16名，教師先后獲江西省青年井岡學者、江西省杰出青年學者、江西省教學名師、江西省中青年骨干教師、江西省優秀黨務工作者、江西省高校最美輔導員、江西省新時代學生心中的好老師等榮譽。近五年來，學院教師獲批國家級科研項目15項，省(部)級科研項目60余項，獲江西省教學成果一等獎、二等獎等教學科研獎勵多項。在Math. Ann., Transactions of AMS, Science China Mathematics, Inverse Problems等重要期刊發表學術論文300余篇，其中被SCI收錄超過100篇。學院教師在全國職業院校技能大賽、江西省高校教師教學創新大賽等重要賽事多次榮獲一等獎，數學教師教育課程群教學團隊榮獲江西省高水平本科教學團隊。

學院現有數學一級學科碩士點，學科教學（數學）專業學位碩士點, 數學與應用數學、數據計算及應用2個本科專業, 其中數學一級學科下設有基礎數學、應用數學、計算數學等多個二級研究方向，2023年順利通過碩士學位點評估驗收。同時，數學與應用數學專業為國家級一流本科專業建設點、江西省四星級本科專業、江西省一流專業、江西省品牌專業及江西省特色專業，2021年開始招收公費師范生，2023年通過教育部師范類專業二級認證，正在試點從師范與應用兩個方向進行分類招生。2023年開辦數學創新實驗班，面向全校招募學生，自主培養拔尖創新人才。2024年數據計算及應用專業首次招生，以適應數字化智能化社會需求。

學院建有兩個南昌市重點實驗室：南昌市數學建模重點實驗室，南昌市分析數學及其應用重點實驗室，為教學和科研工作提供了良好的條件。學校是一所培養職教師資、普教師資和應用型專門人才的多科性本科院校，數學科學學院契合學校培養定位，逐步形成了“一個目標、雙輪驅動、三方協同”的人才培養特色，即以“復合創新型人才”為培養目標，以“分類培養、雙導師制”雙輪進行驅動，地方政府主管部門（產業協會）、高校、企業（中學）等三方協同進行培養的人才培養特色。近三年來，學生在全國大學生建模競賽、全國大學生數學競賽、全國師范生技能大賽、全國大學生統計建模競賽等國家級賽事中均取得較好成績。